Conference Proceeding
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Vom Nutzen und Vorteil von Standards in Lizenzen : 5. Bibliothekskongress Leipzig 2013 ; "Geschäftsvereinbarungen mit dem Buchhandel im digitalen Zeitalter" ; [Vortrag]
(2013)
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Klaus Junkes-Kirchen
- Bibliotheken sind im Erwerbungsalltag mit einer Vielzahl unterschiedlichster Lizenzverträge für die Beschaffung von elektronischen Medien konfrontiert. Dabei nimmt die Komplexität durch das Anwachsen der Zahl der Marktteilnehmer aus Buchhandel und Agenturen, Verlagen und auch der verschiedenen Konsortien sowohl auf nationaler als auch auf internationaler Ebene wie durch die immer größer werdende Vielzahl der Produkte und Lizenzmodelle ständig zu. Die Transaktionskosten bei der Lizenzierung neuer Produkte, aber auch die Aktivitäten zur Verlängerung bestehender Lizenzverträge, steigen proportional mit der Zunahme der Bedeutung und Gewichtung, die elektronische Medienangebote einnehmen. Geschäftsgangmodelle, die ein Verfahren ohne Reibungsverluste garantieren, sind nicht vorhanden - wenn denn ein entsprechendes Problembewusstsein für die Bedeutung und den Wirkungsgrad bestimmter Lizenzvertragsklauseln existiert. Aufgrund der prinzipiell vorhandenen Vertragsfreiheit steht es den Partnern im Grunde frei, einen Vertrag entsprechend den Wünschen und Vorstellungen auszuhandeln. Dies wird in bestimmten Fällen von Vorteil sein, wenn es sich z.B. um Verträge von Konsortien mit Produkteanbietern handelt. Wie aber verhält es sich mit individuell abzuschließenden Lizenzverträgen einzelner Institutionen, z.B. beim Nachkauf von E-Books oder Ergänzungen von weiteren Datenbankprodukten des gleichen Anbieters. In vielen Fällen ist jedesmal ein Lizenzvertrag neu abzuschließen, wobei die minutiöse Lektüre aller Klauseln dringend angeraten sei. Hier würde sich anbieten, den Geschäftsverkehr der Vertragspartner zu vereinfachen, wenn nur schon die Vertragstexte soweit standardisiert wären, dass einheitliche Definitionen und Formulierungen für die einzelnen Regelungspunkte Verwendung fänden und lediglich Sonderabsprachen oder -vereinbarungen als Addenda beizufügen wären.
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Genome-wide multi-parametric analysis of H2AX or γH2AX distributions during ionizing radiation-induced DNA damage response
(2013)
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Francesco Natale
Alexander Rapp
Wei Yu
Marco Durante
Gisela Taucher-Scholz
Maria Cristina Cardoso
- Background: After induction of DNA double strand breaks (DSBs), the DNA damage response (DDR) is activated. One of the earliest events in DDR is the phosphorylation of serine 139 on the histone variant H2AX (gH2AX) catalyzed by phosphatidylinositol 3-kinases-related kinases. Despite being extensively studied, H2AX distribution[1] across the genome and gH2AX spreading around DSBs sites[2] in the context of different chromatin compaction states or transcription are yet to be fully elucidated.
Materials and methods: gH2AX was induced in human hepatocellular carcinoma cells (HepG2) by exposure to 10 Gy X-rays (250 kV, 16 mA). Samples were incubated 0.5, 3 or 24 hours post irradiation to investigate early, intermediate and late stages of DDR, respectively. Chromatin immunoprecipitation was performed to select H2AX, H3 and gH2AX-enriched chromatin fractions. Chromatin-associated DNA was then sequenced by Illumina ChIP-Seq platform. HepG2 gene expression and histone modification (H3K36me3, H3K9me3) ChIP-Seq profiles were retrieved from Gene Expression Omnibus (accession numbers GSE30240 and GSE26386, respectively).
Results: First, we combined G/C usage, gene content, gene expression or histone modification profiles (H3K36me3, H3K9me3) to define genomic compartments characterized by different chromatin compaction states or transcriptional activity. Next, we investigated H3, H2AX and gH2AX distributions in such defined compartments before and after exposure to ionizing radiation (IR) to study DNA repair kinetics during DDR. Our sequencing results indicate that H2AX distribution followed H3 occupancy and, thus, the nucleosome pattern. The highest H2AX and H3 enrichment was observed in transcriptionally active compartments (euchromatin) while the lowest was found in low G/C and gene-poor compartments (heterochromatin). Under physiological conditions, the body of highly and moderately transcribed genes was devoid of gH2AX, despite presenting high H2AX levels. gH2AX accumulation was observed in 5’ or 3’ flanking regions, instead. The same genes showed a prompt gH2AX accumulation during the early stage of DDR which then decreased over time as DDR proceeded.
Finally, during the late stage of DDR the residual gH2AX signal was entirely retained in heterochromatic compartments. At this stage, euchromatic compartments were completely devoid of gH2AX despite presenting high levels of non-phosphorylated H2AX.
Conclusions: We show that gH2AX distribution ultimately depends on H2AX occupancy, the latter following H3 occupancy and, thus, nucleosome pattern. Both H2AX and H3 levels were higher in actively transcribed compartments. However, gH2AX levels were remarkably low over the body of actively transcribed genes suggesting that transcription levels antagonize gH2AX spreading. Moreover, repair processes did not take place uniformly across the genome; rather, DNA repair was affected by genomic location and transcriptional activity. We propose that higher H2AX density in euchromaticcompartments results in high relative gH2AXconcentration soon after the activation of DDR, thus favoring the recruitment of the DNA repair machinery to those compartments. When the damage is repaired and gH2AX is removed, its residual fraction is retained in the heterochromatic compartments which are then targeted and repaired at later times.
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Neue Linsensysteme und Implantate
(2013)
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Thomas Kohnen
- Meeting Abstract: Verein Rheinisch-Westfälischer Augenärzte. 175. Versammlung des Vereins Rheinisch-Westfälischer Augenärzte. Bochum, 01.-02.02.2013.
Im Rahmen des Vortrags wird zunächst ein Überblick über die aktuell angewandten Linsensysteme in der (refraktiven) Kataraktchirurgie sowie im Rahmen des RLA gesprochen. Hierzu zählen die monofokalen sphärischen Standardlinsen, aber auch asphärische, torische und multifokale Implantate.
Speziell wird auf die Ergebnisse einer Studie zu einem neuen multifokalen-torischen Implantat eingegangen. Der Schwerpunkt des Vortrages liegt dann weiterhin auf den trifokalen Korrektionsmöglichkeiten. Zum einen wird die sog. binokulare Trifokalität, bei der zwei multifokale Intraokularlinsen unterschiedlicher Addition implantiert werden, besprochen. Durch die Anpassung jeweils eines Auges an den Intermediär- bzw. Nahbereich soll so bei verringerten optischen Phänomenen ein deutliches Sehen in drei Hauptdistanzen ermöglicht werden. Weiterhin befasst sich der Vortrag aber auch mit den neuen echten trifokalen Optiksystemen, welche ebenfalls deutliches Sehen in verschiedenen Entfernungen gewährleisten können.
Im dritten Teil des Vortrages werden aktuelle Langzeitergebnisse aus einer FDA Studie zur Evaluation einer kammerwinkelgestützten phaken Intraokularlinse, mit speziellem Augenmerk auf den cornealen Endothelzellverlust, sowie eine neuartige sulcusgestütze phake Intraokularlinse mit zentralem Loch zur Glaukomvermeidung vorgestellt.
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SymGRASS: a database of sugarcane orthologous genes involved in arbuscular mycorrhiza and root nodule symbiosis : from Seventh International Meeting on Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics, (CIBB 2010), Palermo, Italy, 16 - 18 September 2010
(2013)
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Luis Carlos Belarmino
Roberta Lane de Oliveira Silva
Nina da Mota Soares Cavalcanti
Nicolas Krezdorn
Ederson Akio Kido
Ralf Horres
Peter Winter
Günter Kahl
Ana Maria Benko-Iseppon
- Background: The rationale for gathering information from plants procuring nitrogen through symbiotic interactions controlled by a common genetic program for a sustainable biofuel production is the high energy demanding application of synthetic nitrogen fertilizers. We curated sequence information publicly available for the biofuel plant sugarcane, performed an analysis of the common SYM pathway known to control symbiosis in other plants, and provide results, sequences and literature links as an online database.
Methods: Sugarcane sequences and informations were downloaded from the nucEST database, cleaned and trimmed with seqclean, assembled with TGICL plus translating mapping method, and annotated. The annotation is based on BLAST searches against a local formatted plant Uniprot90 generated with CD-HIT for functional assignment, rpsBLAST to CDD database for conserved domain analysis, and BLAST search to sorghum's for Gene Ontology (GO) assignment. Gene expression was normalized according the Unigene standard, presented as ESTs/100 kb. Protein sequences known in the SYM pathway were used as queries to search the SymGRASS sequence database. Additionally, antimicrobial peptides described in the PhytAMP database served as queries to retrieve and generate expression profiles of these defense genes in the libraries compared to the libraries obtained under symbiotic interactions.
Results: We describe the SymGRASS, a database of sugarcane orthologous genes involved in arbuscular mycorrhiza (AM) and root nodule (RN) symbiosis. The database aggregates knowledge about sequences, tissues, organ, developmental stages and experimental conditions, and provides annotation and level of gene expression for sugarcane transcripts and SYM orthologous genes in sugarcane through a web interface. Several candidate genes were found for all nodes in the pathway, and interestingly a set of symbiosis specific genes was found.
Conclusions: The knowledge integrated in SymGRASS may guide studies on molecular, cellular and physiological mechanisms by which sugarcane controls the establishment and efficiency of endophytic associations. We believe that the candidate sequences for the SYM pathway together with the pool of exclusively expressed tentative consensus (TC) sequences are crucial for the design of molecular studies to unravel the mechanisms controlling the establishment of symbioses in sugarcane, ultimately serving as a basis for the improvement of grass crops.
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Cellular and nuclear morphology…and calcium signaling: revealing the interplay between structure and function
(2012)
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Markus Breit
Peter von der Bengtson
Anna Hagenston
Hilmar Bading
Gillian Queisser
- Poster presentation: Calcium plays a pivotal role in relaying electrical signals of the cell to subcellular compartments, such as the nucleus. Since this one ion type is used by the cell for many processes a neuron needs to establish finely tuned calcium pathways in order to be able to differentiate multiple tasks, [1-3].
While it is known that neurons can actively change their shape upon neuronal activity, [4-7], we here present novel findings of activity-regulated nuclear morphology, [8,9]. With the help of an experimental and computational modeling approach, we show that hippocampal neurons can change the previously spherical shape of their nuclei to complex and infolded morphologies. This morphology regulation is demonstrated to be regulated by NMDA-receptor gated calcium, while synaptic and extra-synaptic NMDA-receptors elicit opposing effects on nuclear morphology, [8].
The structural alterations of the cell nucleus have significant effects on nuclear calcium dynamics. Compartmentalization of the nucleus, due to membrane infoldings, changes calcium frequencies, amplitudes and spatial distributions, [8,10]. Since these parameters have been shown to control downstream events towards gene transcription, [11,12], the results elucidate the cellular control of nuclear function with the help of morphology modulation. With respect to processes downstream of calcium, we show that histone H3 phosphorylation is closely linked to nuclear morphology. Investigating the nuclear morphologies of hippocampal neurons, two major classes were identified [9,10]. One class contains non-infolded nuclei that have the function of calcium signal integrators, while the other class contains highly infolded nuclei, which function as frequency detectors of nuclear calcium, [10].
Extending this interdisciplinary approach of investigating structure/function relationships in neurons, the effects of cellular morphology – as well as the morphology of the endoplasmic reticulum and other organelles – on neuronal calcium signals is currently being investigated. This endeavor makes use of highly detailed, three-dimensional models of neuronal calcium dynamics, including the three-dimensional morphology of the cell and its organelles.
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Tagungsbericht : "Gegenbilder - literarisch/filmisch/fotografisch" ; Internationales und interdisziplinäres Forschungskolloquium der Bamberger Graduiertenschule für Literatur, Kultur und Medien, 8./9. Juni 2012 in Bamberg
(2012)
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Kathrin Wimmer
- Wir leben in einer Welt voller Bilder. Unser Denken funktioniert in Bildern, die menschliche Kommunikation bedient sich verschiedener Sprachbilder und das mediale Zeitalter überrollt uns mit einer wahren Flut aus bewegten und unbewegten Bildern. Die Moderne greift dabei nicht nur auf den reichen Bilderschatz vergangener Jahrhunderte zurück, sondern es werden auch traditionelle Motive variiert, verändert und verworfen. Das ursprüngliche Bild wird ergänzt durch Gegenbilder und Alternativkonzepte. Letztlich ringen sie alle, Bilder und ihre Gegenbilder, um die Deutungshoheit. Die Veranstalter Corina Erk, M.A., und Christoph Naumann, M.A., eröffneten als Promovierendenvertreter der Bamberger Graduiertenschule für Literatur, Kultur und Medien den Workshop „Gegenbilder – literarisch/filmisch/fotografisch“ und stellten das anspruchsvolle Tagungsprogramm vor, das sich in fünf Sektionen gliederte. Jedes Panel näherte sich aus einer anderen Perspektive dem Themenbündel „Gegenbild“ an.
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Priorisierung in der Medizin – Diskussion einer Realität
(2012)
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Ulrich Finke
Gerd Hoffmann
- Welche gesellschaftlichen Zwänge wirken auf die Medizin und ihre Anwender ein? Wie ist das Verhältnis von Ökonomie und medizinisch Gebotenem? Wie steht es mit der Finanzierung der nicht evidenzbasierten Behandlung? Stellen Rationierung und Rationalisierung die möglichen Prinzipien der Priorisierung dar? Führt die Priorisierung zur Qualitätsminderung oder gar Sorgfaltsverletzung? Diese Fragen behandelte der 4. Ärztetag am Dom in Frankfurt am Main.
Feine Unterschiede – Über Vorliebe und Abneigung im ärztlichen Alltag (Prof. Dr. med. Ralph Bickeböller, niedergelassener Arzt, Frankfurt am Main)
Die Ärzte gehen ihrem Handwerk im Zeichen der Regelleistungsvolumen, der diagnosebezogenen Entgeltpauschalen, der Leitlinien, der Evidence-based-medicine, der Regelung des Sozialgesetzbuches V, der Arznei- und Heilmittelrichtlinie und anderer vielfältiger Bestimmungen nach, so dass allein durch die Vielfalt der Regelungen und durch die Vielzahl der Kontroll- und Regressmechanismen ein System etabliert ist, das einen mehr oder weniger starken Druck auf die Ärzte entfaltet, das Notwendige, Zweckmäßige und Wirtschaftliche am Patienten durchzuführen. Wie steht es mit dem Symbolwert von operativen Eingriffen, wenn man als Operateur für eine Inkontinenzoperation, die vielleicht eine halbe Stunde dauert und zwei postoperative Visiten benötigt, deutlich mehr erlösen kann als für eine organerhaltende Nierentumorresektion von drei Stunden mit sieben postoperativen Visiten? Nicht nur Ärzte haben ihre Prioritäten, u. a. tritt der Patient als Kunde auf, der durch seine Entscheidung für eine Dienstleistung ein Entgelt für den Dienstleistenden generiert. Warum bedürfen wir überhaupt einer Priorisierung in der Medizin? Weil die gesundheitlichen Bedürfnisse der Bürger unbegrenzt sind, weil es den medizinischen Fortschritt gibt und weil die Ressourcen begrenzt sind. Es geht unter anderem deshalb um die Frage, ob es für das Gesamtsystem Medizin gelingen kann, Präferenzen mit einer der festgelegten Rangordnung folgenden Ressourcenverteilung zu entwickeln, die nachvollziehbar, transparent, demokratisch und so weit wie möglich gerecht ist. Aufgrund der notwendigen Rationierung innerhalb des Gesundheitswesens ist deshalb für eine offene Priorisierung das Wort zu reden, die unterschiedliche Präferenzen, unterschiedliche Partizipationsmöglichkeiten, vor allem konkrete Ungerechtigkeiten für ein Leben in Wohlergehen für uns alle wahrnehmen und demokratisch diskutierten lässt.
Die Allokation der stets zu knappen Ressourcen im Gesundheitswesen aus volkswirtschaftlicher Sicht (Prof. Dr. Klaus-Dirk Henke, Fachgebiet Finanzwissenschaft und Gesundheitsökonomie, Technische Universität Berlin)
Die Allokation der stets zu knappen Ressourcen wird anhand einer Fünf-Ebenen-Betrachtung erläutert. Beim top-down und beim bottom-up Ansatz wird deutlich, dass und in welcher Form die unterschiedlichen Verwendungszwecke miteinander konkurrieren. Zu einer wünschenswerten Allokation der Ressourcen gibt es Hinweise aus der Wohlfahrtstheorie, aber keine empirische Basis für eine optimale Zuordnung der knappen Mittel. Anreizkompatible Finanzierungs- und Vergütungssysteme sowie die Ergebnisse der Krankheitskostenrechnungen helfen bei der Verwirklichung einer besseren Allokation. Von zentraler Bedeutung sind jedoch die vier ausgewählten Wettbewerbsfelder im Gesundheitswesen. Außerdem wird für die zukünftige Entwicklung die wachsende Bedeutung des Humankapitals für Wachstum und Produktivität in den Vordergrund gestellt und das Gesundheitswesen innerhalb der vielen Wirtschaftszweige angesichts der Wirtschafts- und Finanzkrise in 2008/2009 als besonders stabil eingeschätzt.
Priorisierung und die deutsche Vergangenheit – Warum die Priorisierungsdebatte so heikel ist (Prof. Dr. Weyma Lübbe, Lehrstuhl für Praktische Philosophie, Universität Regensburg)
Die Debatte über eine Priorisierung medizinischer Maßnahmen ist in Deutschland nach wie vor überwiegend eine akademische Debatte. Von politischer Seite wird das Thema als „unethisch“ bezeichnet und die Diskussion wird durch Negierung der Knappheit vermieden. Diese im internationalen Vergleich auffällige Zurückhaltung der Politik ist auch durch die Angst bedingt, offizielle Stellen könnten durch eine solche Debatte gezwungen werden, vergleichende Urteile über den „Wert“ des (Über-)Lebens verschiedener Patienten oder Patientengruppen zu fällen. Lebenswerturteile von staatlicher Seite waren wesentlicher Bestandteil der Kampagnen, mit denen im Nationalsozialismus das Euthanasie-Programm vorbereitet wurde. Damit möchte niemand auch nur entfernt in Verbindung gebracht werden. Der vorliegende Beitrag argumentiert, dass interpersonell vergleichende Lebenswerturteile kein unvermeidbarer Bestandteil einer Priorisierungsdebatte sind und dass sie in der Tat vermieden werden sollten. Im Rahmen politiknaher Fachkontroversen, namentlich in der Kontroverse zwischen deutschen Gesundheitsökonomen und dem Institut für Qualität und Wirtschaftlichkeit im Gesundheitswesen (IQWiG) über die Methoden der Kosten-Nutzen-Bewertung für Arzneimittel nach § 35 b SGB V, werden sie freilich nicht konsequent vermieden. Eine kontinuierliche kritische Beobachtung und Beurteilung der Implementation ökonomischer Evaluationsmethoden im Blick auf rechtliche und ethische Maßstäbe ist daher unbedingt zu empfehlen.
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[Tagungsbericht zu:] Das Atrium von San Marco in Venedig. Die Genese der Genesismosaiken : Bad Homburg, Forschungskolleg Humanwissenschaften, 22. - 23.06.2012
(2012)
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Rebecca Müller
Herbert L. Kessler
Martin Büchsel
- Bericht der Organisatoren:
Die Tagung wollte ein Zeichen setzen: ein Zeichen, dass es geboten sei, sich erneut der Cotton Genesis und ihrem ausdrücklichsten mittelalterlichen Nachfahren, den Schöpfungsmosaiken der Vorhalle von San Marco in Venedig, zuzuwenden. Die Diskussion dieser Verbindung von frühchristlichen Illuminationen, die nur noch in wenigen verkohlten Fragmenten überliefert sind, mit den mittelalterlichen Mosaiken ist seit der Entdeckung durch Johan Jakob Tikkanen 1889 geführt worden. Sie kam 1986 mit der Edition der Cotton Genesis durch Kurt Weitzmann und Herbert Kessler zu einem vorläufigen Abschluss. Die Mosaiken erschienen als weitgehend getreue Kopie der Buchmalereien der Handschrift, die dabei allein redaktionelle, aber keine konzeptionelle Veränderungen durch die Mosaizisten erfahren hätten...
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Sepsis 2012 : Paris, France, 7 - 9 November 2012 ; meeting abstracts
(2012)
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5-Lipoxygenase contributes to PPAR [gamma] activation in macrophages in response to apoptotic cells
(2012)
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Andreas von Knethen
Lisa Eifler
Laura Kuchler
Annika Heeg
Heinrich Heide
Ilka Wittig
Thorsten Jürgen Maier
Dieter Steinhilber
Bernhard Brüne
- Background: One hallmark contributing to immune suppression during the late phase of sepsis is macrophage polarization to an anti-inflammatory phenotype upon contact with apoptotic cells (AC). Taking the important role of the nuclear receptor PPARγ for this phenotype switch into consideration, it remains elusive how AC activate PPARγ in macrophages. Therefore, we were interested to characterize the underlying principle.
Methods: Apoptosis was induced by treatment of Jurkat T cells for 3 hours with 0.5 μg/ml staurosporine. Necrotic cells (NC) were prepared by heating cells for 20 minutes to 65°C. PPARγ activation was followed by stably transducing RAW264.7 macrophages with a vector encoding the red fluorescent protein mRuby after PPARγ binding to 4 × PPRE sites downstream of the reporter gene sequence. This readout was established by treatment with the PPARγ agonist rosiglitazone (1 μM) and AC (5:1). Twenty-four hours after stimulation, mRuby expression was analysed by fluorescence microscopy. Lipid rafts of AC, NC, as well as living cells (LC) were enriched by sucrose gradient centrifugation. Fractions were analysed for lipid raft-associated marker proteins. Lipid rafts were incubated with transduced RAW264.7 macrophages as described above. 5-Lipoxygenase (5-LO) involvement was verified by pharmacological inhibition (MK-866, 1 μM) and overexpression.
Results: Assuming that the molecule responsible for PPARγ activation in macrophages is localized in the cell membrane of AC, most probably associated to lipid rafts, we isolated lipid rafts from AC, NC and LC. Mass spectrometric analysis of lipid rafts of AC showed the expression of 5-LO, whereas lipid rafts of LC did not. Moreover, incubating macrophages with lipid rafts of AC induced mRuby expression. In contrast, lipid rafts of NC and LC did not. To verify the involvement of 5-LO in activating PPARγ in macrophages, Jurkat T cells were incubated for 30 minutes with the 5-LO inhibitor MK-866 (1 μM) before apoptosis induction. In line with our hypothesis, these AC did not induce mRuby expression. Finally, although living Jurkat T cells overexpressing 5-LO did not activate PPARγ in macrophages, mRuby expression was significantly increased when AC were generated from 5-LO overexpressing compared with wild-type Jurkat cells.
Conclusion: Our results suggest that induction of apoptosis activates 5-LO, localizing to lipid rafts, necessary for PPARγ activation in macrophages. Therefore, it will be challenging to determine whether 5-LO activity in AC, generated from other cell types, correlates with PPARγ activation, contributing to an immune-suppressed phenotype in macrophages.
